衛生福利部公告「受聘僱外國人入國後健康檢查指定醫院」名單，全台各縣市包含離島地區，共計有72家指定醫院。此外，國立台灣大學醫學院附設雲林分院為試辦醫院，亦可辦理受聘僱外國人入國後健康檢查及外籍人士居留或定居健檢業務。
| 編號 |
醫院 |
醫院 |
醫院名稱 | 指定效期 |
| 1 | C01 | 基隆市 | 長庚醫療財團法人基隆長庚紀念醫院 | 至109年6月30日 |
| 2 | C03 | 衛生福利部基隆醫院 | 至107年12月31日 | |
| 3 | A05 | 臺北市 | 台灣基督長老教會馬偕醫療財團法人馬偕紀念醫院 | 至109年12月31日 |
| 4 | A06 | 國泰醫療財團法人國泰綜合醫院（總院） | 至107年6月30日 | |
| 5 | A07 | 臺北市立聯合醫院－陽明院區 | 至107年6月30日 | |
| 6 | A08 | 臺北市立聯合醫院－忠孝院區 | 至107年6月30日 | |
| 7 | A09 | 臺北市立聯合醫院－仁愛院區 | 至107年6月30日 | |
| 8 | A10 | 臺北市立聯合醫院－和平婦幼院區 (和平) | 至107年6月30日 | |
| 9 | A11 | 新光醫療財團法人新光吳火獅紀念醫院 | 至107年6月30日 | |
| 10 | A14 | 基督復臨安息日會醫療財團法人臺安醫院 | 至107年12月31日 僅辦理外籍人士居留健檢業務 |
|
| 11 | A15 | 三軍總醫院松山分院附設民眾診療服務處 | 至109年12月31日 | |
| 12 | A17 | 臺北市立聯合醫院－中興院區 | 至107年6月30日 | |
| 13 | A19 | 臺北市立萬芳醫院 | 至107年6月30日 | |
| 14 | H01 | 新北市 | 台灣基督長老教會馬偕醫療財團法人淡水馬偕紀念醫院 | 至108年6月30日 |
| 15 | H03 | 醫療財團法人徐元智先生醫藥基金會亞東紀念醫院 | 至107年6月30日 | |
| 16 | H04 | 天主教耕莘醫療財團法人耕莘醫院（新店總院） | 至107年6月30日 | |
| 17 | H06 | 衛生福利部雙和醫院 | 至108年6月30日 | |
| 18 | I01 | 桃園市 | 長庚醫療財團法人林口長庚紀念醫院 | 至109年12月31日 |
| 19 | I02 | 衛生福利部桃園醫院 | 至109年12月31日 | |
| 20 | I03 | 國軍桃園總醫院附設民眾診療服務處 | 至107年6月30日 | |
| 21 | I04 | 敏盛綜合醫院（三民院區） | 至109年12月31日 | |
| 22 | I05 | 臺北榮民總醫院桃園分院 | 至109年12月31日 | |
| 23 | I06 | 壢新醫院 | 至109年12月31日 | |
| 24 | I07 | 沙爾德聖保祿修女會醫療財團法人聖保祿醫院 | 至107年12月31日 | |
| 25 | I08 | 天成醫療社團法人天晟醫院 | 至109年12月31日 | |
| 26 | D01 | 新竹市 | 國立臺灣大學醫學院附設醫院新竹分院 | 至109年12月31日 |
| 27 | W01 | 苗栗縣 | 衛生福利部苗栗醫院 | 至108年12月31日 |
| 28 | W02 | 財團法人為恭紀念醫院 | 至107年6月30日 | |
| 29 | E01 | 臺中市 | 臺中榮民總醫院 | 至107年12月31日 |
| 30 | E03 | 中國醫藥大學附設醫院 | 至107年6月30日 | |
| 31 | E06 | 衛生福利部臺中醫院 | 至109年12月31日 | |
| 32 | E07 | 佛教慈濟醫療財團法人台中慈濟醫院 | 至109年6月30日 | |
| 33 | K01 | 衛生福利部豐原醫院 | 至109年12月31日 | |
| 34 | K03 | 光田醫療社團法人光田綜合醫院（沙鹿總院） | 至107年6月30日 | |
| 35 | K06 | 童綜合醫療社團法人童綜合醫院（梧棲院區） | 至109年12月31日 | |
| 36 | K08 | 仁愛醫療財團法人大里仁愛醫院 | 至107年6月30日 | |
| 37 | L02 | 彰化縣 | 彰化基督教醫療財團法人彰化基督教醫院（彰化總院） | 至109年12月31日 |
| 38 | L03 | 秀傳醫療社團法人秀傳紀念醫院（彰化市） | 至107年6月30日 | |
| 39 | L04 | 衛生福利部彰化醫院 | 至109年12月31日 | |
| 40 | X01 | 南投縣 | 埔基醫療財團法人埔里基督教醫院 | 至107年12月31日 |
| 41 | V01 | 雲林縣 | 國立臺灣大學醫學院附設醫院雲林分院（斗六院區） | 自98年12月17日起受理健檢 |
| 42 | G01 | 嘉義市 | 戴德森醫療財團法人嘉義基督教醫院 | 至109年12月31日 |
| 43 | G03 | 天主教中華聖母修女會醫療財團法人天主教聖馬爾定醫院 | 至109年12月31日 | |
| 44 | T02 | 嘉義縣 | 佛教慈濟醫療財團法人大林慈濟醫院 | 至107年6月30日 |
| 45 | T03 | 長庚醫療財團法人嘉義長庚紀念醫院 | 至107年12月31日 | |
| 46 | F01 | 臺南市 | 國立成功大學醫學院附設醫院 | 至108年6月30日 |
| 47 | F02 | 衛生福利部臺南醫院 | 至107年12月31日 | |
| 48 | F03 | 台南市立醫院 | 至107年6月30日 | |
| 49 | F05 | 台灣基督長老教會新樓醫療財團法人台南新樓醫院 | 至107年6月30日 | |
| 50 | F06 | 郭綜合醫院 | 至107年6月30日 | |
| 51 | M01 | 奇美醫療財團法人奇美醫院（永康院區） | 至107年6月30日 | |
| 52 | M02 | 奇美醫療財團法人柳營奇美醫院 | 至107年6月30日 | |
| 53 | B01 | 高雄市 | 高雄榮民總醫院 | 至108年12月31日 |
| 54 | B02 | 財團法人私立高雄醫學大學附設中和紀念醫院 | 至107年6月30日 | |
| 55 | B04 | 國軍高雄總醫院左營分院附設民眾診療服務處 | 至109年12月31日 | |
| 56 | B06 | 阮綜合醫療社團法人阮綜合醫院 | 至107年6月30日 | |
| 57 | B07 | 高雄市立小港醫院 | 至107年6月30日 | |
| 58 | B08 | 高雄市立大同醫院 | 至108年12月31日 | |
| 59 | N01 | 長庚醫療財團法人高雄長庚紀念醫院 | 至109年12月31日 | |
| 60 | N02 | 義大醫療財團法人義大醫院 | 至109年12月31日 | |
| 61 | U02 | 屏東縣 | 衛生福利部屏東醫院 | 至109年6月30日 |
| 62 | U03 | 安泰醫療社團法人安泰醫院 | 至107年12月31日 | |
| 63 | J01 | 宜蘭縣 | 財團法人天主教靈醫會羅東聖母醫院 | 至107年6月30日 |
| 64 | J02 | 財團法人羅許基金會羅東博愛醫院 | 至107年6月30日 | |
| 65 | J03 | 國立陽明大學附設醫院 | 至108年6月30日 | |
| 66 | O02 | 花蓮縣 | 佛教慈濟醫療財團法人花蓮慈濟醫院 | 至109年12月31日 |
| 67 | O03 | 臺灣基督教門諾會醫療財團法人門諾醫院 | 至109年12月31日 | |
| 68 | O04 | 臺北榮民總醫院玉里分院 | 至109年12月31日 | |
| 69 | P01 | 臺東縣 | 台灣基督長老教會馬偕醫療財團法人台東馬偕紀念醫院 | 至107年6月30日 |
| 70 | Q01 | 澎湖縣 | 衛生福利部澎湖醫院 | 至107年6月30日 |
| 71 | Q02 | 三軍總醫院澎湖分院附設民眾診療服務處 | 至107年6月30日 | |
| 72 | R02 | 金門縣 | 衛生福利部金門醫院 | 至107年6月30日 |
| 73 | S01 | 連江縣 | 連江縣立醫院 | 至107年6月30日 |
資料來源：衛生福利部疾病管制署
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